Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax8Q00288 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax8Q00288 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms