Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmb4P99026 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms