Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp11aP98197 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11aP98197 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp11aP98197 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms