Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21,55■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Brca2P97929 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Brca2P97929 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21,54■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Brca2P97929 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Brca2P97929 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Brca2P97929 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Brca2P97929 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21,47■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Brca2P97929 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,03
Brca2P97929 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Brca2P97929 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Brca2P97929 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21,45■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Brca2P97929 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Brca2P97929 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Brca2P97929 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21,41■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Brca2P97929 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Brca2P97929 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21,38■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Brca2P97929 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Brca2P97929 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,8 ms