Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cry1P97784 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cry1P97784 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cry1P97784 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cry1P97784 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cry1P97784 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cry1P97784 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cry1P97784 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cry1P97784 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms