Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited1P97769 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited1P97769 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227.3 ms