Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pitx2P97474 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms