Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad4P97471 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad4P97471 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad4P97471 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad4P97471 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smad4P97471 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad4P97471 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad4P97471 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad4P97471 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad4P97471 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad4P97471 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad4P97471 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad4P97471 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad4P97471 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad4P97471 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad4P97471 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms