Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas1P97459 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas1P97459 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas1P97459 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas1P97459 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas1P97459 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas1P97459 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas1P97459 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms