Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smyd1P97443 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smyd1P97443 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smyd1P97443 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms