Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nkx2-3P97334 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx2-3P97334 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nkx2-3P97334 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms