Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx1P82976 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbx1P82976 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx1P82976 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms