Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gabpb2P81069 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabpb2P81069 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms