Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb1P70662 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldb1P70662 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms