Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cux2P70298 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Cux2P70298 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cux2P70298 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Cux2P70298 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cux2P70298 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cux2P70298 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cux2P70298 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cux2P70298 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cux2P70298 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cux2P70298 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cux2P70298 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cux2P70298 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cux2P70298 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cux2P70298 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cux2P70298 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Cux2P70298 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cux2P70298 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms