Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp3P70281 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp3P70281 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms