Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf6P70279 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf6P70279 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf6P70279 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf6P70279 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Surf6P70279 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf6P70279 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf6P70279 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf6P70279 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Surf6P70279 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Surf6P70279 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf6P70279 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms