Protein–RNA interactions for Protein: P70213

Fv1, Friend virus susceptibility protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv1P70213 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv1P70213 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv1P70213 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv1P70213 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv1P70213 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv1P70213 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv1P70213 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv1P70213 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv1P70213 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv1P70213 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv1P70213 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fv1P70213 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv1P70213 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fv1P70213 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv1P70213 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv1P70213 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms