Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps17P63276 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps17P63276 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps17P63276 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps17P63276 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps17P63276 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps17P63276 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms