Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39P62892 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms