Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm5P62322 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms