Protein–RNA interactions for Protein: P61375

Lhx5, LIM/homeobox protein Lhx5, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx5P61375 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx5P61375 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx5P61375 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx5P61375 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms