Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme3P61290 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme3P61290 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme3P61290 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme3P61290 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme3P61290 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms