Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia3P60469 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia3P60469 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms