Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcbp1P60335 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcbp1P60335 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcbp1P60335 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms