Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rin3P59729 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rin3P59729 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rin3P59729 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rin3P59729 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rin3P59729 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rin3P59729 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rin3P59729 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rin3P59729 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rin3P59729 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rin3P59729 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rin3P59729 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rin3P59729 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rin3P59729 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rin3P59729 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rin3P59729 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rin3P59729 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rin3P59729 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rin3P59729 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rin3P59729 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rin3P59729 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rin3P59729 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rin3P59729 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rin3P59729 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms