Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp1P59054 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Csrnp1P59054 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms