Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp3P58854 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp3P58854 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp3P58854 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms