Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Setd4P58467 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd4P58467 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd4P58467 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd4P58467 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setd4P58467 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setd4P58467 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setd4P58467 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd4P58467 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd4P58467 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd4P58467 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd4P58467 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd4P58467 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Setd4P58467 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms