Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Exosc10P56960 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc10P56960 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms