Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gsc2P56916 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsc2P56916 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms