Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd38P56528 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd38P56528 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd38P56528 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd38P56528 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd38P56528 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd38P56528 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd38P56528 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd38P56528 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd38P56528 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd38P56528 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd38P56528 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd38P56528 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms