Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf5P56477 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf5P56477 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf5P56477 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf5P56477 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf5P56477 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irf5P56477 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irf5P56477 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf5P56477 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irf5P56477 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms