Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ephb4P54761 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb4P54761 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms