Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb3P54754 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ephb3P54754 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms