Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23aP54726 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23aP54726 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23aP54726 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23aP54726 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad23aP54726 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad23aP54726 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad23aP54726 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23aP54726 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23aP54726 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rad23aP54726 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23aP54726 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23aP54726 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23aP54726 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23aP54726 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23aP54726 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23aP54726 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23aP54726 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms