Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Msh6P54276 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Msh6P54276 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Msh6P54276 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Msh6P54276 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msh6P54276 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Msh6P54276 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Msh6P54276 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Msh6P54276 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Msh6P54276 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Msh6P54276 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msh6P54276 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Msh6P54276 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msh6P54276 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msh6P54276 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Msh6P54276 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Msh6P54276 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Msh6P54276 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Msh6P54276 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Msh6P54276 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Msh6P54276 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms