Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CebpaP53566 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CebpaP53566 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CebpaP53566 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CebpaP53566 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CebpaP53566 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CebpaP53566 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CebpaP53566 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CebpaP53566 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms