Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2e3P52483 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms