Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1cP52432 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1cP52432 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr1cP52432 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1cP52432 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1cP52432 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1cP52432 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1cP52432 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms