Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec1P51908 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec1P51908 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec1P51908 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec1P51908 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec1P51908 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec1P51908 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apobec1P51908 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec1P51908 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms