Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XpcP51612 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XpcP51612 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
XpcP51612 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XpcP51612 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XpcP51612 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XpcP51612 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XpcP51612 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XpcP51612 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XpcP51612 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XpcP51612 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XpcP51612 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XpcP51612 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XpcP51612 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XpcP51612 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XpcP51612 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XpcP51612 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XpcP51612 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XpcP51612 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XpcP51612 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XpcP51612 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XpcP51612 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
XpcP51612 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XpcP51612 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XpcP51612 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XpcP51612 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
XpcP51612 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XpcP51612 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XpcP51612 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XpcP51612 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XpcP51612 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XpcP51612 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XpcP51612 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XpcP51612 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XpcP51612 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XpcP51612 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XpcP51612 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XpcP51612 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XpcP51612 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XpcP51612 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XpcP51612 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XpcP51612 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XpcP51612 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XpcP51612 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XpcP51612 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XpcP51612 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XpcP51612 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
XpcP51612 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XpcP51612 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XpcP51612 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XpcP51612 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XpcP51612 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XpcP51612 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XpcP51612 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XpcP51612 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
XpcP51612 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XpcP51612 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XpcP51612 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XpcP51612 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
XpcP51612 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XpcP51612 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XpcP51612 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XpcP51612 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XpcP51612 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XpcP51612 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
XpcP51612 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XpcP51612 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
XpcP51612 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XpcP51612 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XpcP51612 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XpcP51612 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
XpcP51612 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
XpcP51612 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
XpcP51612 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XpcP51612 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XpcP51612 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XpcP51612 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XpcP51612 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XpcP51612 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XpcP51612 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XpcP51612 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XpcP51612 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XpcP51612 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XpcP51612 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XpcP51612 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XpcP51612 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XpcP51612 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
XpcP51612 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XpcP51612 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XpcP51612 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XpcP51612 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XpcP51612 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XpcP51612 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XpcP51612 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XpcP51612 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XpcP51612 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
XpcP51612 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
XpcP51612 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XpcP51612 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XpcP51612 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms