Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TspoP50637 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TspoP50637 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TspoP50637 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TspoP50637 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TspoP50637 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TspoP50637 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TspoP50637 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TspoP50637 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TspoP50637 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TspoP50637 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TspoP50637 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TspoP50637 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TspoP50637 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TspoP50637 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TspoP50637 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TspoP50637 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TspoP50637 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TspoP50637 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TspoP50637 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TspoP50637 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TspoP50637 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TspoP50637 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TspoP50637 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TspoP50637 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TspoP50637 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TspoP50637 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TspoP50637 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TspoP50637 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TspoP50637 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TspoP50637 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TspoP50637 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TspoP50637 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TspoP50637 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TspoP50637 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TspoP50637 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TspoP50637 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TspoP50637 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TspoP50637 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TspoP50637 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TspoP50637 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TspoP50637 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TspoP50637 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TspoP50637 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TspoP50637 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TspoP50637 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TspoP50637 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TspoP50637 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TspoP50637 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TspoP50637 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TspoP50637 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TspoP50637 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TspoP50637 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TspoP50637 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TspoP50637 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TspoP50637 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TspoP50637 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TspoP50637 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TspoP50637 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TspoP50637 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TspoP50637 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TspoP50637 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TspoP50637 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TspoP50637 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TspoP50637 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TspoP50637 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TspoP50637 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TspoP50637 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TspoP50637 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TspoP50637 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TspoP50637 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TspoP50637 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TspoP50637 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TspoP50637 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TspoP50637 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TspoP50637 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TspoP50637 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TspoP50637 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TspoP50637 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TspoP50637 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TspoP50637 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TspoP50637 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TspoP50637 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TspoP50637 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TspoP50637 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TspoP50637 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TspoP50637 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms