Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TubP50586 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TubP50586 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TubP50586 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TubP50586 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TubP50586 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TubP50586 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TubP50586 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TubP50586 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TubP50586 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TubP50586 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TubP50586 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TubP50586 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TubP50586 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TubP50586 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TubP50586 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TubP50586 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TubP50586 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TubP50586 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TubP50586 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TubP50586 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TubP50586 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TubP50586 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TubP50586 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TubP50586 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TubP50586 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TubP50586 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TubP50586 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TubP50586 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TubP50586 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TubP50586 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TubP50586 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TubP50586 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TubP50586 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TubP50586 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TubP50586 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TubP50586 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TubP50586 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TubP50586 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TubP50586 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TubP50586 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TubP50586 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TubP50586 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TubP50586 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TubP50586 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TubP50586 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TubP50586 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TubP50586 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TubP50586 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TubP50586 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TubP50586 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TubP50586 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TubP50586 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TubP50586 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TubP50586 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TubP50586 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TubP50586 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TubP50586 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TubP50586 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TubP50586 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TubP50586 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TubP50586 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TubP50586 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TubP50586 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TubP50586 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TubP50586 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TubP50586 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TubP50586 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TubP50586 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TubP50586 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TubP50586 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TubP50586 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TubP50586 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TubP50586 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TubP50586 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TubP50586 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TubP50586 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TubP50586 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TubP50586 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TubP50586 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TubP50586 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TubP50586 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TubP50586 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TubP50586 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TubP50586 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TubP50586 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TubP50586 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TubP50586 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TubP50586 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TubP50586 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TubP50586 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms