Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CtshP49935 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CtshP49935 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CtshP49935 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CtshP49935 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CtshP49935 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtshP49935 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtshP49935 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtshP49935 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtshP49935 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtshP49935 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtshP49935 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtshP49935 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CtshP49935 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CtshP49935 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CtshP49935 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CtshP49935 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CtshP49935 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CtshP49935 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CtshP49935 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CtshP49935 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtshP49935 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtshP49935 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtshP49935 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtshP49935 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtshP49935 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtshP49935 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtshP49935 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtshP49935 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtshP49935 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtshP49935 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtshP49935 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtshP49935 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtshP49935 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtshP49935 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtshP49935 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtshP49935 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtshP49935 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtshP49935 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtshP49935 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CtshP49935 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtshP49935 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtshP49935 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtshP49935 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtshP49935 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtshP49935 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtshP49935 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CtshP49935 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtshP49935 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtshP49935 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CtshP49935 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtshP49935 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtshP49935 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtshP49935 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtshP49935 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtshP49935 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtshP49935 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtshP49935 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtshP49935 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtshP49935 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtshP49935 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtshP49935 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CtshP49935 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtshP49935 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtshP49935 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtshP49935 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtshP49935 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtshP49935 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CtshP49935 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtshP49935 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtshP49935 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtshP49935 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtshP49935 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtshP49935 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtshP49935 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtshP49935 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtshP49935 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtshP49935 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtshP49935 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtshP49935 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtshP49935 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtshP49935 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtshP49935 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CtshP49935 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtshP49935 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtshP49935 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtshP49935 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtshP49935 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtshP49935 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtshP49935 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtshP49935 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtshP49935 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtshP49935 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtshP49935 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtshP49935 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtshP49935 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtshP49935 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CtshP49935 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CtshP49935 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtshP49935 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms