Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbp3P49194 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbp3P49194 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms