Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcd1P48410 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcd1P48410 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms