Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rfx1P48377 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx1P48377 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms