Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Epb41P48193 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb41P48193 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb41P48193 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb41P48193 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb41P48193 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb41P48193 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epb41P48193 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb41P48193 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Epb41P48193 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epb41P48193 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms