Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgavP43406 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgavP43406 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgavP43406 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgavP43406 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgavP43406 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgavP43406 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgavP43406 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms